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SciFinder检索疑难解析-反应.pdf

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朱传娴 客户顾问 hzhu@acs-i.org SciFinder反应检索难点解析 2017.12 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 提纲 • SciFinder反应检索难点解析 – 反应的精准定义 – 巧妙获得有实验步骤的相关反应 – 如何获得最全面的合成信息 – 反应信息太少时如何获得更多的反应信息 – 结果集庞大时如何限定反应 – 直接检索反应受限时如何处理 – 如何排除不要的反应 – 新化合物的合成路线设计 – 聚合反应的检索 – 案例分析 – 反应检索上机练习 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 2 SciFinder检索选项——反应检索 ▪ 反应检索方法 结构式 ▪ 常用获取方法 已知物质:由物质获取反应 已知文献:从文献中获取反应 精确结构反应检索 亚结构反应检索 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 3 反应绘制工具 反应箭头 反应角色工具 反应原子 标记工具 官能团列表 反应位置 标记工具 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 4 反应的精准定义 检索符合以下要求的反应,硝基还原 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 5 巧妙获得有实验步骤的相关反应 该还原反应如何操作? ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 6 巧妙获得有反应步骤的相关反应 聚焦反应关键部位,查找类似反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 7 巧妙获得有反应步骤的相关反应 通过Refine获得单步反应后选取有实验步骤的反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 8 获得全面的合成信息 查找合成Daclatasvir的反应 9 获得全面的合成信息 还有其他文献描述了目标化合物的合成吗? ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 10 获得全面的合成信息 获得的附加反应不是完整反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 11 获得全面的合成信息 合并后的文献结果集 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 12 获得相关的反应信息 反应信息太少,通过Similar Reaction 获得更多反应信息 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 70 反应结果集庞大时如何限定—反应试剂的限定 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 14 反应结果集庞大时如何限定—反应试剂的限定 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 15 反应结果集庞大时如何限定—反应试剂的限定 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 16 反应结果集庞大时如何限定—反应试剂的限定 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 17 反应结果集庞大时如何限定—催化剂的限定 获得四三苯基磷钯作为催化剂的反应 1. 先获得四三苯基磷钯这个化合物 2. 获得催化剂的反应 18 反应结果集庞大时如何限定—催化剂的限定 如有结构,再通过Refine做结构限定 19 直接检索反应受限的处理 检索如下构型翻转的反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 20 手性拆分反应 如何检索如下消旋体拆分获得绝对构型的反应? N-保护的3-氨基-甲基哌啶 举例:R1可以是一些保护基,比如Boc、Cbz等, 甲基可以在吡啶环的2,4,5或6位的任意位置。 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 21 手性拆分反应: • 检索思路1:不考虑物质的手性,快速检索 • 检索思路2:考虑物质的手性,精准检索 • 都是从物质检索出发,然后获取反应,再限定反应物和产物结构 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 22 手性拆分反应:检索思路1 • 从产物的反应检索出发 在反应结构编辑器中,同时绘制两个产物结构(无需画立体构型), 选择亚结构反应检索 • 限定反应物 在反应结果集中,通过Refine: Reaction structure对反应进行限定,所 画结构为没有立体构型的反应物 • 获得结果集 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 23 手性拆分反应:从产物的反应检索出发 反应 绘制无立体键的产物,并标明角色为”产物” CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 亚结构反应检索 24 手性拆分反应:限定反应物 绘制没有立体构型的反应物 在反应结果集中通过Reaction Structure限定反应物 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 25 手性拆分反应:获得反应结果集 对映异构体的分离 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 26 检索思路2 • 从物质检索出发,获取反应 ➢ 反应物的反应:从物质检索出发,获取反应物(挑选没有立体构型的物质结果集) 结果集,点击Get Reaction获得反应结果集1 ➢ 产物的反应:与1采取相同策略(挑选具有绝对立体构型的物质结果集),获得产 物的反应结果集2。 • 反应结果集处理 ➢ 合并反应结果集1与2,取交集获得结果集3 ➢ 在3的结果集中,用Reaction Structure进行Refine处理:同时绘制两个产物结构(无 需画立体构型),并标明角色都为产物 ➢ 查看反应结果集,可根据需求(如反应步数,产率,反应类型等)限定结果 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 27 手性拆分反应: • 检索思路1:不考虑物质的手性,有噪音,但快速获得结果; • 检索思路2:考虑物质的手性,步骤稍多,但无噪音,精准获得结果; • 可根据检索要求的复杂程度,灵活地选择检索策略,进行快速或精准 的检索。 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 28 SciFinder中的反应排除策略 在做以下反应的过程中,不允许使用硫醇作为反应物 S R CHO R n S 29 获得全部符合反应变化要求的反应 ▪ 使用R基团定义 R1=Ak,Cy ▪ 使用重复基团定义 ,定义产物C原子 的重复阈值 ▪ 使用原子标记工具 ,标记成环位置。 30 获得全部符合反应变化要求的反应 31 获得全部符合反应变化要求的反应 大部分反应都是用硫醇 32 获得全部符合反应变化要求的反应 先将结果集保存 33 获得需要排除的反应 34 获得需要排除的反应 这里限定出来的都是我们不需要的反应 35 获得需要排除的反应 36 去除不要的反应—Combine 37 最后的结果 38 新化合物合成路线设计 检索思路1:检索结构相似的物质,获得有参考价值的合成路线; 检索思路2:检索通式结构,获得有参考价值的合成路线; 检索思路3:先自行做逆合成反应分析,然后验证相关的反应。 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 39 新化合物合成路线设计 检索思路1:检索相似结构,获得有参考价值的合成路线 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 40 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 41 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 42 新化合物合成路线设计 检索思路2:检索通式结构,获得有参考价值的合成路线 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 43 新化合物合成路线设计 筛选结构相近的物质 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 44 新化合物合成路线设计 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 45 新化合物合成路线设计 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 46 新化合物合成路线设计 检索思路3:先自行做逆合成反应分析,然后检索相关的反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 47 逆合成反应分析 1 + 2 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 48 新化合物合成路线设计 反应1 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 49 新化合物合成路线设计 问题:反应太乱 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 50 新化合物合成路线设计 进一步筛选 酰化剂为羧酸,不符合要求 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 51 新化合物合成路线设计 进一步限定用酯做酰化剂的反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 52 新化合物合成路线设计 反应2 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 53 聚合反应 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 54 聚合反应 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 55 聚合物改性反应 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 56 聚合物改性反应 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 57 聚合物改性反应:进一步筛选反应物/试剂 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 58 聚合物改性反应:获得筛选后的改性反应 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 59 聚合物改性反应——Si材料上羟基的酯化 60 聚合物改性反应——Si材料上羟基的酯化 问题:如何找到含Si的聚合物上的羟基酯化反应? 61 聚合物改性反应——含Si高分子材料上羟基的酯化 聚合物 62 聚合物改性反应——含Si高分子材料上羟基的酯化 63 聚合物改性反应——含Si高分子材料上羟基的酯化 64 聚合物改性反应——含Si高分子材料上羟基的酯化 65 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 符合要求的反应 66 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 不符合要求的反应 如何去除? 67 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 思路一:筛出原料中已经包含酯化物的反应 68 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 希望筛除的反应 69 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 不希望筛除的反应 思路一不可行! 70 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 思路二:筛出产物中仍包含硅羟基的反应 都是希望筛除的反应 71 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 都是符合要求的反应 72 案例分析 检索要求: – 某个结构中包含环和Cbz,环上存在Br或者I – 寻找脱Cbz的一步反应,而环上卤素不脱掉 定义困难: 如何定义这个环系,杂环?C环? Cbz和环的连接方法 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 73 案例分析 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 74 案例分析 存在我们想要的结果集 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 75 案例分析 存在大量的环与Cbz不 在一个结构上的反应 如何去除? ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 76 案例分析 这种类型的反应, 需要先去检索和反 应相关的物质 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 77 案例分析 需要定义为单一组分和具备 反应物或试剂角色的物质 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 78 案例分析 获得所有可能的反应物,并获 得这些物质作为反应物的反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 79 案例分析 这些反应中的反应物都包含要求的结构, 需进一步把产物限定进去。 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 80 案例分析 先限定反应步数 为一步反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 81 案例分析 再做反应中心限定,沿用之前的定义 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 82 案例分析 都是我们想要的反应结果 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 83 SciFinder中的检索思路 ▪ 初步检索 ▪ 浏览结果集,判断是否符合要求,利用系统工具限定结果 ▪ 修正检索式,再次检索 ▪ 浏览结果集,判断 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 84 上机练习 1. 检索以下反应: 2. 底物上有伯羟基和仲羟基,能否找到合适的氧化剂使伯羟基氧化成醛 而仲羟基不受影响? 3. 检索保护吲哚环上N原子而环上的羟基不受影响的反应? ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 85 SciFinder使用注意事项 ▪ 在校园内完成注册(教室、图书馆、实验室) ▪ 一人注册一个帐号 ▪ 请提供真实姓名的汉语拼音 ▪ 严禁过量下载 ▪ 严禁账号分享 ▪ 严禁将账号用于非学术研究 ▪ 严禁在其他研究院所使用中科大的账号 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 86 更多培训资料请访问 www.cas-china.org ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 87 美国化学文摘社北京代表处 010-62508026 china@acs-i.org ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 88

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