SciFinder检索疑难解析-反应.pdf
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朱传娴 客户顾问 hzhu@acs-i.org SciFinder反应检索难点解析 2017.12 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 提纲 • SciFinder反应检索难点解析 – 反应的精准定义 – 巧妙获得有实验步骤的相关反应 – 如何获得最全面的合成信息 – 反应信息太少时如何获得更多的反应信息 – 结果集庞大时如何限定反应 – 直接检索反应受限时如何处理 – 如何排除不要的反应 – 新化合物的合成路线设计 – 聚合反应的检索 – 案例分析 – 反应检索上机练习 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 2 SciFinder检索选项——反应检索 ▪ 反应检索方法 结构式 ▪ 常用获取方法 已知物质：由物质获取反应 已知文献：从文献中获取反应 精确结构反应检索 亚结构反应检索 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 3 反应绘制工具 反应箭头 反应角色工具 反应原子 标记工具 官能团列表 反应位置 标记工具 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 4 反应的精准定义 检索符合以下要求的反应，硝基还原 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 5 巧妙获得有实验步骤的相关反应 该还原反应如何操作？ ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 6 巧妙获得有反应步骤的相关反应 聚焦反应关键部位，查找类似反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 7 巧妙获得有反应步骤的相关反应 通过Refine获得单步反应后选取有实验步骤的反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 8 获得全面的合成信息 查找合成Daclatasvir的反应 9 获得全面的合成信息 还有其他文献描述了目标化合物的合成吗？ ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 10 获得全面的合成信息 获得的附加反应不是完整反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 11 获得全面的合成信息 合并后的文献结果集 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 12 获得相关的反应信息 反应信息太少，通过Similar Reaction 获得更多反应信息 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 70 反应结果集庞大时如何限定—反应试剂的限定 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 14 反应结果集庞大时如何限定—反应试剂的限定 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 15 反应结果集庞大时如何限定—反应试剂的限定 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 16 反应结果集庞大时如何限定—反应试剂的限定 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 17 反应结果集庞大时如何限定—催化剂的限定 获得四三苯基磷钯作为催化剂的反应 1. 先获得四三苯基磷钯这个化合物 2. 获得催化剂的反应 18 反应结果集庞大时如何限定—催化剂的限定 如有结构，再通过Refine做结构限定 19 直接检索反应受限的处理 检索如下构型翻转的反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 20 手性拆分反应 如何检索如下消旋体拆分获得绝对构型的反应？ N-保护的3-氨基-甲基哌啶 举例：R1可以是一些保护基，比如Boc、Cbz等， 甲基可以在吡啶环的2,4,5或6位的任意位置。 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 21 手性拆分反应： • 检索思路1：不考虑物质的手性，快速检索 • 检索思路2：考虑物质的手性，精准检索 • 都是从物质检索出发，然后获取反应，再限定反应物和产物结构 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 22 手性拆分反应：检索思路1 • 从产物的反应检索出发 在反应结构编辑器中，同时绘制两个产物结构（无需画立体构型）， 选择亚结构反应检索 • 限定反应物 在反应结果集中，通过Refine: Reaction structure对反应进行限定，所 画结构为没有立体构型的反应物 • 获得结果集 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 23 手性拆分反应：从产物的反应检索出发 反应 绘制无立体键的产物,并标明角色为”产物” CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 亚结构反应检索 24 手性拆分反应：限定反应物 绘制没有立体构型的反应物 在反应结果集中通过Reaction Structure限定反应物 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 25 手性拆分反应：获得反应结果集 对映异构体的分离 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 26 检索思路2 • 从物质检索出发，获取反应 ➢ 反应物的反应：从物质检索出发，获取反应物（挑选没有立体构型的物质结果集） 结果集，点击Get Reaction获得反应结果集1 ➢ 产物的反应：与1采取相同策略（挑选具有绝对立体构型的物质结果集），获得产 物的反应结果集2。 • 反应结果集处理 ➢ 合并反应结果集1与2，取交集获得结果集3 ➢ 在3的结果集中，用Reaction Structure进行Refine处理：同时绘制两个产物结构（无 需画立体构型），并标明角色都为产物 ➢ 查看反应结果集，可根据需求（如反应步数，产率，反应类型等）限定结果 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 27 手性拆分反应： • 检索思路1：不考虑物质的手性，有噪音，但快速获得结果； • 检索思路2：考虑物质的手性，步骤稍多，但无噪音，精准获得结果； • 可根据检索要求的复杂程度，灵活地选择检索策略，进行快速或精准 的检索。 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 28 SciFinder中的反应排除策略 在做以下反应的过程中，不允许使用硫醇作为反应物 S R CHO R n S 29 获得全部符合反应变化要求的反应 ▪ 使用R基团定义 R1=Ak,Cy ▪ 使用重复基团定义 ，定义产物C原子 的重复阈值 ▪ 使用原子标记工具 ，标记成环位置。 30 获得全部符合反应变化要求的反应 31 获得全部符合反应变化要求的反应 大部分反应都是用硫醇 32 获得全部符合反应变化要求的反应 先将结果集保存 33 获得需要排除的反应 34 获得需要排除的反应 这里限定出来的都是我们不需要的反应 35 获得需要排除的反应 36 去除不要的反应—Combine 37 最后的结果 38 新化合物合成路线设计 检索思路1：检索结构相似的物质，获得有参考价值的合成路线； 检索思路2：检索通式结构，获得有参考价值的合成路线； 检索思路3：先自行做逆合成反应分析，然后验证相关的反应。 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 39 新化合物合成路线设计 检索思路1：检索相似结构，获得有参考价值的合成路线 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 40 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 41 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 42 新化合物合成路线设计 检索思路2：检索通式结构，获得有参考价值的合成路线 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 43 新化合物合成路线设计 筛选结构相近的物质 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 44 新化合物合成路线设计 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 45 新化合物合成路线设计 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 46 新化合物合成路线设计 检索思路3：先自行做逆合成反应分析，然后检索相关的反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 47 逆合成反应分析 1 + 2 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 48 新化合物合成路线设计 反应1 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 49 新化合物合成路线设计 问题：反应太乱 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 50 新化合物合成路线设计 进一步筛选 酰化剂为羧酸，不符合要求 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 51 新化合物合成路线设计 进一步限定用酯做酰化剂的反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 52 新化合物合成路线设计 反应2 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 53 聚合反应 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 54 聚合反应 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 55 聚合物改性反应 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 56 聚合物改性反应 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 57 聚合物改性反应：进一步筛选反应物/试剂 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 58 聚合物改性反应：获得筛选后的改性反应 CAS is a division of the American Chemical Society. Copyright 2017 American Chemical Society. All rights reserved. 59 聚合物改性反应——Si材料上羟基的酯化 60 聚合物改性反应——Si材料上羟基的酯化 问题：如何找到含Si的聚合物上的羟基酯化反应？ 61 聚合物改性反应——含Si高分子材料上羟基的酯化 聚合物 62 聚合物改性反应——含Si高分子材料上羟基的酯化 63 聚合物改性反应——含Si高分子材料上羟基的酯化 64 聚合物改性反应——含Si高分子材料上羟基的酯化 65 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 符合要求的反应 66 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 不符合要求的反应 如何去除？ 67 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 思路一：筛出原料中已经包含酯化物的反应 68 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 希望筛除的反应 69 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 不希望筛除的反应 思路一不可行！ 70 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 思路二：筛出产物中仍包含硅羟基的反应 都是希望筛除的反应 71 亚结构反应检索——含Si高分子材料上羟基的酯化 都是符合要求的反应 72 案例分析 检索要求： – 某个结构中包含环和Cbz，环上存在Br或者I – 寻找脱Cbz的一步反应，而环上卤素不脱掉 定义困难： 如何定义这个环系，杂环？C环？ Cbz和环的连接方法 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 73 案例分析 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 74 案例分析 存在我们想要的结果集 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 75 案例分析 存在大量的环与Cbz不 在一个结构上的反应 如何去除？ ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 76 案例分析 这种类型的反应， 需要先去检索和反 应相关的物质 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 77 案例分析 需要定义为单一组分和具备 反应物或试剂角色的物质 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 78 案例分析 获得所有可能的反应物，并获 得这些物质作为反应物的反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 79 案例分析 这些反应中的反应物都包含要求的结构， 需进一步把产物限定进去。 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 80 案例分析 先限定反应步数 为一步反应 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 81 案例分析 再做反应中心限定，沿用之前的定义 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 82 案例分析 都是我们想要的反应结果 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 83 SciFinder中的检索思路 ▪ 初步检索 ▪ 浏览结果集，判断是否符合要求，利用系统工具限定结果 ▪ 修正检索式，再次检索 ▪ 浏览结果集，判断 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 84 上机练习 1. 检索以下反应： 2. 底物上有伯羟基和仲羟基，能否找到合适的氧化剂使伯羟基氧化成醛 而仲羟基不受影响？ 3. 检索保护吲哚环上N原子而环上的羟基不受影响的反应？ ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 85 SciFinder使用注意事项 ▪ 在校园内完成注册（教室、图书馆、实验室） ▪ 一人注册一个帐号 ▪ 请提供真实姓名的汉语拼音 ▪ 严禁过量下载 ▪ 严禁账号分享 ▪ 严禁将账号用于非学术研究 ▪ 严禁在其他研究院所使用中科大的账号 ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 86 更多培训资料请访问 www.cas-china.org ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 87 美国化学文摘社北京代表处 010-62508026 china@acs-i.org ACS / Proprietary and Confidential / Do Not Distribute 88